Protein–RNA interactions for Protein: P35227

PCGF2, Polycomb group RING finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF2P35227 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PCGF2P35227 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms