Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GJA4P35212 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
GJA4P35212 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms