Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
OTX2P32243 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
OTX2P32243 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTX2P32243 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTX2P32243 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTX2P32243 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
OTX2P32243 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
OTX2P32243 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms