Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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CASQ1P31415 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CASQ1P31415 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CASQ1P31415 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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