Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HOXC13P31276 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.2 ms