Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLIP1P30622 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CLIP1P30622 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms