Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CMPK1P30085 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CMPK1P30085 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms