Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ARID4AP29374 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ARID4AP29374 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
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