Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
HOXD10P28358 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms