Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DNMT1P26358 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DNMT1P26358 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms