Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LMO2P25791 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LMO2P25791 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms