Protein–RNA interactions for Protein: P24522

GADD45A, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45AP24522 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GADD45AP24522 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms