Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD53P19397 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CD53P19397 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CD53P19397 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms