Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SPI1P17947 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SPI1P17947 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms