Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CHRNB1P11230 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CHRNB1P11230 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms