Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LAMC1P11047 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms