Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD8BP10966 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD8BP10966 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms