Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RHOP08100 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RHOP08100 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RHOP08100 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RHOP08100 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHOP08100 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHOP08100 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms