Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SERPIND1P05546 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms