Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
THY1P04216 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
THY1P04216 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
THY1P04216 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms