Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
GABARAPO95166 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GABARAPO95166 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GABARAPO95166 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.8 ms