Protein–RNA interactions for Protein: O60934

NBN, Nibrin, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBNO60934 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NBNO60934 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NBNO60934 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NBNO60934 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBNO60934 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBNO60934 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NBNO60934 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms