Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PLXNC1O60486 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PLXNC1O60486 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms