Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CXCL13O43927 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms