Protein–RNA interactions for Protein: O43711

TLX3, T-cell leukemia homeobox protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLX3O43711 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TLX3O43711 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TLX3O43711 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TLX3O43711 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms