Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
UBDO15205 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
UBDO15205 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
UBDO15205 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms