Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TO15178 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TO15178 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TO15178 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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