Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SETD1AO15047 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SETD1AO15047 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms