Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SOCS6O14544 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms