Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
NEDD8-MDP1E9PL57 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms