Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HMGB1P1B2RPK0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HMGB1P1B2RPK0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms