Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NOTOA8MTQ0 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NOTOA8MTQ0 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms