Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C4orf47A7E2U8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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