Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

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Length 308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CFAP73A6NFT4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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CFAP73A6NFT4 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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CFAP73A6NFT4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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CFAP73A6NFT4 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CFAP73A6NFT4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CFAP73A6NFT4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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