Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KLHL33A6NCF5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms