Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MAP3K4Q9Y6R4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MAP3K4Q9Y6R4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms