Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID3

VPS51, Vacuolar protein sorting-associated protein 51 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS51Q9UID3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
VPS51Q9UID3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms