Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CTNNA3Q9UI47 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CTNNA3Q9UI47 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms