Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
DKK2Q9UBU2 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
DKK2Q9UBU2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms