Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR1

UPB1, Beta-ureidopropionase, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPB1Q9UBR1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UPB1Q9UBR1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
UPB1Q9UBR1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms