Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
REREQ9P2R6 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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