Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SCHIP1Q9P0W5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SCHIP1Q9P0W5 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms