Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EHD3Q9NZN3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms