Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX76

CMTM6, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM6Q9NX76 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CMTM6Q9NX76 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms