Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TDP1Q9NUW8 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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