Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPMQ9NSP4 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms