Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHST12Q9NRB3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHST12Q9NRB3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms