Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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FANCFQ9NPI8 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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