Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms