Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRPM3Q9HCF6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms